Поясните, пожалуйста, будет ли какая-то разница между регистрацией лотереи в ФНС России (насколько я знаю такого органа нет, есть городские ФНС, межрайонные и т.п.) и ФНС Курской области?
Это официальный сайт "органа, которого нет" -
www.nalog.ru. Разницы особой не будет кроме того, что в Курской области регистрацией региональных лотерей занимается не ФНС Курской области, а Комитет потребительского рынка, развития малого предпринимательства и лицензирования Курской области через областное государственной учреждение "Многофункциональный центр по предоставлению государственных и муниципальных услуг". Более подробная информация
здесь.